코돈 최적화는 표적 유전자의 유전자 코드를 미세 조정하여 단백질 발현 수준과 생물학적 활성을 향상시키는 최첨단 기술입니다. 다년간의 업계 경험을 가진 유전자 합성 전문인 GenCefe Biotech는 사용자의 다운스트림 응용 시, 코돈 최적화의 중요한 역할을 충분히 이해하고 있습니다. 우리는 코돈 최적화에 고급 인공 지능 기술을 도입하고 OptiGene™ 코돈 최적화 도구를 독자적으로 개발하여보다 최적화 된 알고리즘으로 연구 및 응용 프로그램을 지원합니다.

장점:

• 맞춤형 코돈 최적화: 호스트 유기체에 맞도록 유전자 염기서열을 최적화하여 번역(translation) 효율성을 높이고 편향을 최소화합니다.

• 단백질 수율 (yield) 극대화: 수요가 많은 응용 분야를 위해 단백질 생산을 향상시킵니다.

• 향상된 기능성: 재조합 단백질의 접힘, 안정성 및 활성을 향상시킵니다.

• 다양한 호스트 호환성: 박테리아, 효모, 식물 및 포유류 세포 등에서 모두 서비스가 가능합니다.

연구 사례: 대장균에서 진핵 단백질 발현의 7.4배 증가

목적: 대장균에서 OptiGene™에 의해 최적화된 진핵 유전자의 발현 수준의 평가

방법: 야생형 SKN-1 유전자는 당사의 OptiGene™ 소프트웨어 및 수순에 의해 분석되고 최적화되었습니다. 이어, 최적화된 유전자를 대장균 발현 벡터 내로 클로닝한 뒤, 이 유전자를 함유한 세균을 배양하여 단백질 발현을 유도 하였으며, 야생형 유전자와 비교하였습니다. 단백질 발현은 western-blot으로 확인하였습니다. 각각의 최적화된 유전자 또는 야생형 유전자의 3개의 클론을 조사하고, 그 결과를 그림 1에 나타내었습니다.

결과: 최적화된 SKN-1 유전자를 함유하는 3개의 클론은 야생형을 함유하는 클론에 비해 각각 6배, 7.2배 및 9배 증가를 보였으며, 평균 7.4배 증가.

그림 1.: 왼쪽: 야생형 및 최적화된 SKN-1 유전자를 발현하는 박테리아 추출물의 단백질 전기영동. 오른쪽: Western Blot에 의한 단백질 정량 분석.