연구 사례 1—13.7 kb 유전자 합성 및 플라스미드 변형

13.7kb 유전자 염기서열을 합성, 결합하여 고객이 지정한 지정된 벡터 부위에 클로닝했습니다. 염기서열 분석을 통해 염기서열이 100% 정확한 것으로 확인되었으며 GenCefe는 고품질 플라스미드를 성공적으로 전달했습니다.

프로젝트의 난이도

• 시퀀스 길이는 13.7kb에 이르며 구성 중에 삭제 (deletions)되기 용이

• 벡터는 고객에 의해 제공되었으며, 벡터에 표적 유전자를 삽입하기 위한 적절한 제한 부위가 없음

• 벡터의 낮은 복사율로 준비하기 어려움

GenCefe 솔루션

• 이 제안은 숙련된 기술 전문가가 설계했습니다. 당사의 독점적인 조립 기술을 사용하여 정확한 전체 길이의 시퀀스를 보장하였습니다.

• 벡터 수정을 수행하고 수정된 벡터의 지정된 위치에 표적 서열을 성공적으로 복제하였습니다.

• 자체 개발한 도구 세포와 포뮬러 배지를 사용하여 플라스미드 복제 수를 증가시켰습니다.

연구 사례 2 - 합성하기 어려운 유전자 염기서열(PolyA-rich)

110개의 연속적인 PolyA를 포함하는 유전자 서열은 잘 합성되었고 시퀀싱을 통해 성공적으로 검증되었습니다. 그리고 100% 염기서열이 정확한 플라스미드가 고객에게 전달되었습니다.

프로젝트의 난이도

이 서열은 최대 110개 염기의 연속 PolyA 구조를 포함하여 큰 반복 구조를 포함합니다. 이러한 연속적인 단일 염기 반복은 플라스미드 불안정성 및 비정상적인 시퀀싱 신호를 유발할 수 있습니다.

GenCefe 솔루션

• 이 시퀀스를 위해 특정 합성 체계가 설계

• 돌연변이를 줄이기 위해 최적화 된 구성 및 클로닝 프로토콜 적용

• 정확한 검증을 보장하기 위해 최적화된 염기서열 분석 프로토콜 적용

연구 사례 3 - 합성하기 어려운 유전자 염기서열(GC-rich)

우리는 높은 GC 함량, 순방향 DNA 반복 및 고분자 구조를 포함하는 유전자 서열을 성공적으로 합성하고 검증했습니다. 그리고 염기서열이 100% 로 정확한 플라스미드가 고객에게 전달되었습니다.

프로젝트의 난이도

• GC가 풍부한 영역은 전체 길이의 >35%를 차지하였으며, GC 함량은 눈에 띄게 변동합니다. 이러한 구조는 종종 비특이적 증폭으로 이어지고 표적 유전자를 증폭하지 못하는 원인이 됩니다.

• 정방향 DNA 반복과 폴리머 구조가 총 서열의 >30%를 차지합니다. 반복적인 시퀀스는 합성/조립에 어려움을 일으키고 폴리머 구조는 순서 결정에 어려움을 줍니다.

GenCefe 솔루션

• 이 서열을 위해 특정 합성 체계가 설계되었고 유전자 서열은 세그먼트로 합성

• 정확한 전체 길이 시퀀스를 보장하기 위해 독점적인 기술을 사용하여 조립

• 구성 및 복제 프로토콜을 최적화하여 돌연변이 최소화

• 정확한 검증을 보장하기 위해 염기서열 분석 프로토콜을 최적화

GenCefe 유전자 합성 서비스